Los gobiernos regionales se encuentran en un proceso de instalación de capacidades y transferencia de competencias en los ámbitos de Planificación Regional y de Ordenamiento Territorial.

Aysén fue una región pionera que realizó su propio Plan Regional de Ordenamiento Territorial en el año 2002, con recursos del Fondo Nacional de Desarrollo Regional (FNDR). Si bien este documento es de carácter indicativo, ha sido una fuente de referencia para el sector público y privado. Así mismo, se realizó la Macrozonificación del Borde Costero que, a diferencia de la anterior, cuenta con un marco normativo sobre la base del Decreto Supremo Nro 153, de 20 de mayo de 2004; éste establece la zonificación de la Región de Aysén, tras su toma de razón por parte de la Contraloría General de la República. Actualmente, se está avanzado en la Microzonificación del Borde Costero, labor que realiza SERPLAC.